Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP2O95045 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UPP2O95045 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UPP2O95045 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP2O95045 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP2O95045 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP2O95045 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP2O95045 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP2O95045 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP2O95045 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP2O95045 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPP2O95045 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms