Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3DO95025 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms