Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms