Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD6O60522 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms