Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPLO60437 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPLO60437 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPLO60437 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPLO60437 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPLO60437 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPLO60437 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms