Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GATCO43716 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GATCO43716 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GATCO43716 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GATCO43716 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GATCO43716 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms