Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENRO43583 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENRO43583 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms