Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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