Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms