Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms