Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms