Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEURL1BA8MQ27 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEURL1BA8MQ27 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms