Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WASHC1A8K0Z3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WASHC1A8K0Z3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WASHC1A8K0Z3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WASHC1A8K0Z3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WASHC1A8K0Z3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms