Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms