Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms