Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NBASA2RRP1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms