Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms