Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PLD3Q8IV08 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms