Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SFTPA3P-201ENST00000446429 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL209P-201ENST00000488309 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 KLF7P1-201ENST00000490941 1048 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-202ENST00000344578 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU4-8P-201ENST00000364936 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-205ENST00000381563 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-209ENST00000397304 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FBXO36-IT1-201ENST00000432957 582 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC083939.1-201ENST00000445475 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-210ENST00000446240 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 UQCRBP3-201ENST00000509483 312 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL408P-201ENST00000577207 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms