Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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