Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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