Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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