Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms