Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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