Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NEUROD1Q13562 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms