Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LAMA3Q16787 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 696.4 ms