Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms