Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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