Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXC1Q12948 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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