Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRIQ1Q96JM4 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRIQ1Q96JM4 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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