Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3GALT2U3KPV4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A3GALT2U3KPV4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms