Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms