Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP3Q9Y3E7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP3Q9Y3E7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms