Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFT52Q9Y366 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms