Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRAP3Q9Y2W1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRAP3Q9Y2W1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms