Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms