Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms