Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF8Q9UPP1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms