Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms