Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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USP18Q9UMW8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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