Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms