Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMYND8Q9ULU4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms