Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED23Q9ULK4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED23Q9ULK4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms