Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PADI1Q9ULC6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms