Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRXN1Q9ULB1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms