Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA2Q9UL42 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA2Q9UL42 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms