Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms