Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms