Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms