Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms